Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui : 1) Pengaruh suku bunga terhadap deposito mudharabah. 2) pengaruh bagi hasil terhadap deposito mudharabah. 3) Pengaruh inflasi terhadap deposito mudharabah. 4) pengaruh FDR terhadap deposito mudharabah. 5) pengaruh ukuran Bank terhadap deposito mudharabah. Penelitian ini merupakan penelitian kuantitatif. Subjek penelitian ini adalah BPR Syariah yang ada di daerah Istimewa Yogyakarta yang berjumlah 8 BPR Syariah. Pengumpulan data diambil dari laporan yang telah dipublikasikan oleh Otoritas Jasa Keungan dan Bank Indonesia. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa : 1) Suku bunga berpengaruh negative signifikan terhadap pertumbuhan dana deposito mudharabah. 2) Bagi hasil berpengaruh positif signifikan terhadap pertumbuhan dana deposito mudharabah. 3) Inflasi berpengaruh negative signifikan terhadap pertumbuhan dana deposito mudharabah. 4) FDR (Finance Deposit of Ratio) berpengaruh negative signifikan terhadap pertumbuhan dana deposito mudharabah. 5) Ukuran Bank berpengaruh positif signifikan terhadap pertumbuhan dana deposito mudharabah.