OPTIMASI METODE GO-SELEX (GRAPHENE OXIDE- SYSTEMATIC EVOLUTION OF LIGANDS BY EXPONENTIAL ENRICHMENT) PADA SELEKSI APTAMER DENGAN TARGET GELATIN BABI (SUS SCROFA DOMESTICA)
Abstract
Alat deteksi kontaminan halal yang dapat diaplikasi di lapangan dengan cepat, efisien, portable dan dapat digunakan untuk sampel dalam jumlah banyak seperti strip test saat ini masih terbatas serta harus diimpor dari luar negeri. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan alat deteksi cepat terhadap kontaminan halal dalam produk makanan maupun farmasi yang berbasis DNA aptamer. DNA aptamer suatu molekul yang memiliki karakter yang analog dengan antibodi, dapat diseleksi dari suatu pustaka oligonukleotida dengan metode SELEX. Metode SELEX yang dimodifikasi dengan aplikasi grafen oksida (GO-SELEX) dilakukan untuk meningkatkan efisiensi proses seleksi. Seleksi 10 siklus dengan masing-masing diikuti dengan pemurnian menggunakan teknik PCR asimetris. Sequencing dilakukan terhadap 25 aptamer yang terseleksi, selanjutnya dilakukan uji pengikatan, uji selektivitas dan bioassay dengan aptamer.
Hasil penelitian ini mempunyai novelitas yang tinggi dan berpotensi untuk dipublikasikan di jurnal-jurnal yang ber-impact factor dan terindeks Scopus. Pengembangan lebih lanjut dari sistem deteksi cepat khususnya yang berbasis aptamer berpotensi untuk didaftarkan hak paten karena sejauh penelusuran yang dilakukan belum ada yang mengembangkan alat deteksi untuk autentikasi halal berbasis DNA aptamer. Hasil penelitian ini juga diharapkan dapat mendorong inovasi dan daya saing bangsa Indonesia di sektor industri halal serta selaras dengan diterapkannya UU Jaminan Produk Halal.