Rumah sakit sebagai instalasi pelayanan medis tidak mungkin lepas dari keberadaan sejumlah mikroorganisme. Hampir pada semua ruangan didapatkan mikroorganisme yang tersuspensi dengan udara. Ukuran sel mikroorganisme yang sedemikian kecil menyebabkan mudah terhembus oleh aliran udara. Penyebaran mikroorganisme di udara berasal dari partikel debu yang masuk dalam ruangan. Keberadaan mikroorganisme ini akan berpengaruh pada ruangan yang seharusnya terjaga kesterilisannya seperti ruang operasi, laboratorium dan farmasi. Penelitian ini bertujuan untuk membuat alat sterilisator ruangan dengan UV protection berbasis microcontroller ATMega 328p. Komponen yang digunakan yaitu lampu UV 45 watt untuk membunuh bakteri, IC Atmega 328p untuk mengontrol sistem kerja keseluruhan dan fan untuk menghisap udara di ruangan. Pengujian alat dilakukan di Laboratorium Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Muhammadiyah Yogyakarta. Dari hasil pengujian didapatkan waktu sterilisasi ruangan dengan lampu UV ultraviolet 45 watt dengan luas ruangan 21 m³ selama 15 menit didapatkan koloni sebelum sterilisasi yaitu sangat penuh/tidak dapat dihitung dan setelah dilakukan sterilisasi 26 koloni. Selanjutnya dilakukan sterilisasi selama 30 menit didapatkan hasil sebelum sterilisasi 60 koloni dan setelah dilakukan sterilisasi 15 koloni. Selanjutnya dilakukan sterilisasi selama 45 menit didapatkan hasil sebelum sterilisasi 25 koloni dan setelah dilakukan sterilisasi 4 koloni. Dari hasil pengujian timer selama 15 menit dengan 20 kali percobaan didapatkan rata-rata 897,85 detik, penyimpangan 2,15 detik dan error 0,23%. Pengujian timer selama 30 menit didapatkan rata-rata 1,798,5 detik, penyimpangan 1,5 detik dan error 0,08%. Pengujian timer selama 45 menit didapatkan rata-rata 2.697 detik, penyimpangan 2,69 detik dan error 0,09%.