Latar Belakang : Penelitian ini membahas tentang pemahaman staf terhadap suatu program maternal dan neonatal yang ada di Indonesia yaitu program PONEK (Pelayanan Obstetri Neonatal Emergensi Komprehensif) yang program tersebut khusus diselenggarakan di Rumah Sakit Pemerintah atau Rumah Sakit Swasta yang rumah sakit tersebut ditunjuk sebagai rumah sakit PONEK, penelitian ini berfokus pada perbandingan kinerja staff terhadap program PONEK rumah sakit. Peran staf medis dalam menjalankan suatu program organisasi kesehatan sangat berpengaruh dalam keberhasilan suatu program kesehatan dan pemberian pelayanan. PONEK merupakan program pemerintah dalam rangka meminimalisir masalah kesehatan yang ada di Indonesia khususnya angka kematia ibu dan bayi. Metode : Total jumlah sampel pada penelitian ini adalah 41 responden (21 responden RS Pemerintah dan 19 responden RS Swasta), analisi statistik yang digunakan pada penelitian ini adalah Mann Whitney. Hasil : Dari 6 faktor yang mempengaruhi kinerja, terdapat 2 faktor yang memiliki perbedaan signifikan, yaitu faktor kerjasama dengan nilai p 0,01<ɑ(0,05) dan dukungan atasan dengan nilai p 0,024<ɑ(0,05). Kesimpulan : Dari hasil tersebut kinerja pegawai rumah sakit swasta dibanding rumah sakit pemerintah memiliki perbedaan signifikan dalam hal faktor kerjasama dan faktor dukungan atasan.