Latar Belakang: Rumah Sakit PKU Muhammadiyah Bantul telah mengembangkan konsep rumah sakit siaga bencana sejak tahun 2008 melalui pelatihan Hospital Preparedness for Emergency and Disaster (HOPE). Pengukuran kesiapsiagaan rumah sakit diperlukan untuk identifikasi dan klasifikasi penanggulangan bencana. Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk mengukur kapasitas fungsional Rumah Sakit PKU Muhammadiyah Bantul dalam penanggulangan bencana. Metode: Penelitian berupa deskriptif kualitatif yang diambil dengan menggunakan metode purposive sampling. Sampel adalah pegawai yang memiliki jabatan dalam manajemen bencana rumah sakit. Instrumen pengukuran menggunakan kriteria Hospital Safety Index 2015 yang terdiri atas tiga kelompok indeks. Sebanyak 33 item penilaian diperoleh melalui wawancara, observasi lingkungan dan dokumen penanggulangan bencana. Hasil: Indeks kapasitas fungsional adalah 0,71. Skor masing-masing kelompok indeks berkisar antara 0,5 hingga 0,83. Skor tertinggi adalah 0,83 untuk kelompok indeks rencana tanggap darurat. Kelompok indeks tim komite bencana memiliki skor terendah yaitu 0,8. Sedangkan kelompok indeks ketersediaan obat, instrumen,dan peralatan untuk situasi bencana 0,5. Simpulan: Indeks kapasitas fungsional rumah sakit adalah 0,71, termasuk kategori A yang mengindikasikan bahwa fasilitas kesehatan dapat melindungi hidup manusia yang ada di dalamnya dan dinilai dapat tetap berfungsi dalam situasi bencana.