Sistem remunerasi sangat penting untuk mengatasi perubahan pembiayaan pelayanan kesehatan yang dilakukan oleh rumah sakit yang semula fee for servise menjadi paket INA-CBGs. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui dan mengkaji pengaruh sistem remuenrasi terhadap mutu pelayanan, efektivitas biaya, dan luaran rumah sakit. Metode penelitian yang digunakan adalah pendekatan kuantitatif dengan survei cross sectional dengan penyebaran kuesioner pada 165 dari berbagai rumah sakit di Indonesia. Analisis data menggunakan structural Equation Model yaitu Partial Least Square. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sistem remunerasi berpengaruh positif dan signifikan terhadap mutu pelayanan, efektivitas biaya dan luaran rumah sakit.Implikasinya, untuk meningkatkan mutu pelayanan, efektivitas biaya, dan luaran rumah sakit salah satu strategi yang sudah terbukti adalah dengan mengembangkan sistem remunerasi yang adil, transparan dan proporsional.