Salah satu permasalahan terbesar dalam dunia Islam, khususnya terkait dengan perkembangan sains dan teknologi adalah masalah sekularisme. Dalam sejarah terbukti bahwa pada masa periode dinasti abasiyah dan umayah, di saat Islam sedang mencapai puncak kejayaannya, seluruh aspek ilmu pengetahuan dan teknologi semua di kuasai oleh para cendekiawan Muslim. Islam lah penguasa peradaban dunia pada saat itu. Namun, seiring berjalannya waktu, di saat Peradaban Islam mulai mundur, lahirlah peradaban Barat dengan Renaisansnya dan di saat Barat berada dalam masa kejayaan, ilmu pengetahuan yang awalnya dikembangkan oleh para ilmuwan Muslim, kemudian direbut Barat serta mereka melakukan upaya sekularisasi. Berangkat dari permasalahan tersebut, LPPI UMY bekerjasama dengan Pusat Islamisasi Ilmu UNIDA Gontor, duduk Bersama untuk menyusun strategi guna melakukan upaya islamisasi ilmu pengetahuan kontemporer yang telah tersekularkan.