Tujuan dari penelitian ini untuk memperdalam bagaimana pelaksanaan hukuman yang ada di pesantren, yang nantinya ditelusuri tentang karakteristik dari hukuman–hukuman yang ada di tiga tipe pesantren; yakni pesantren salafiyah, khalafiyah dan kombinasi (antara pesantren salafiyah dan khalafiyah). Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah pendekatan content analysis, di mana peneliti akan menelusuri isi dan kebermaknaan dari hukuman yang ada di tiga jenis pesantren. Peneliti akan menelusuri isi dari hasil-hasil penelitian sebelumnya (baik skripsi, tesis, disertasi ataupun jurnal penelitian) terkait dengan hukuman yang ada di pesantren salafiyah, khalafiyah dan kombinasi. Ada dua hal yang menjadi dua temuan penelitian. Pertama, hukuman yang diberlakukan di tiga pesantren menyesuaikan dengan jenis kenakalan-kenakalan yang dilakukan santri; kenakalan santri jenis ringan, sedang dan berat, dan masing-masing beragam bentuk hukumannya. Temuan kedua, ada dua jenis hukuman yang ada di pesantren yakni hukuman legal dan hukuman ilegal, hukuman legal adalah hukuman resmi dari pesantren, sedangkan hukuman ilegal adalah hukuman tidak resmi dari pesantren yang dilakukan oleh senior kepada yunior yang lemah dengan dasar balas dendam, ketidaksukaan dan kebencian.