Posisi organisasi trans nasional dapat mengancam Negara Kesatuan Republik Indonesia (NKRI). Oleh karenanya masyarakat harus dapat mewaspadai gerakan-gerakan trans nasional yang berada di sekitarnya. Bagaimanapun juga organsiasi trans nasional akan dapat menimbulkan dampak negatif terhadap loyalitas dalam berbangsa dan bernegara.