Hasil penelitian ini menunjukkan kepercayaan diri siswa MTS Muhammadiyah Kasihan Bantul berada pada kategori sedang, dengan skor rata-rata kepercayaan diri sebesar 88,64%. Prestasi belajar PAI siswa MTS Muhammadiyah Kasihan Bantul Yogyakarta berada pada kategori sedang, dengan skor rata-rata prestasi belajar PAI sebsar 86,36%. Hasil perhitungan dengan menggunakan SPSS 11.5 for windows diperoleh angka koefisien korelasi (r) sebesar 0,008. Angka ini lebih kecil dari pada r tabel pada taraf signifikansi 5% yaitu 0,304. Sehingga dapat disimpulkan bahwa Hipotesis alternatif diterima dan Hipotesis nol ditolak. Hal ini berarti terdapat hubungan yang sangat rendah antara tingkat kepercayaan diri dan prestasi belajar PAI siswa MTS Muhammadiyah Kasihan Bantul Yogyakarta.