Tingkat kolesterol total bervariasi pada hipotiroidisme. Penelitian tentang kadar kolesterol total pada pasien hipotiroid dan non-hipotiroid telah dilakukan. Tujuan dari peneltiian ini adalah untuk mengukur kadar kolesterol total pasien hipotiroid dibandingkan dengan non-hipotiroid daerah endemik GAKY. Semakin tinggi tingkat kolesterol total pada subjek hipotiroid adalah karena gangguan metabolisme HDL kolesterol pada jalur transportasi kolesterol terbalik, terutama pada aktivitas enzim lecithin kolesterol acyltranferase. Hal tersebut membuat tingkat HDL kolesterol menjadi lebih rendah, sedangkan HDL adalah transporter utama kolesterol darah kembali ke hepar, yang nantinya akan dikonversi dan dikeluarkan sebagai asam empedu. Sebagai kesimpulan , kadar kolesterol total pada ibu menyusui hipotiroid di daerah endemis GAKI lebih tinggi dari kadar kolesterol total pada ibu menyusui non-hipotiroid.