Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pengaruh inflasi, nilai tukar, dan BI Rate terhadap tabungan Mudharabah pada Bank Muamalat dan Bank BPD Syariah DIY. Data yang digunakan adalah data time series periode Januari 2013- Desember 2015, yang dipublikasikan oleh Bank Indonesia dari Laporan Statistik Perbankan Syariah. Metode analisis yang digunakan dalam penelitian ini adalah menggunakan metode Regresi Linier Berganda yaitu Ordinary Least Square (OLS). Berdasarkan Uji Parsial, maka diperoleh hasilnya sebagai berikut, Inflasi berpengaruh negatif dan tidak signifikan signifikan terhadap Tabungan Mudharabah pada Bank BPD Syariah DIY dan bank Muamalat. Nilai tukar berpengaruh negatif dan tidak signifikan terhadap Tabungan Mudharabah pada Bank BPD Syariah DIY. Sebaliknya, Nilai Tukar berpengaruh postif terhadap Tabungan Mudharabah pada Bank Muamalat. BI Rate berpengaruh positif dansignifikan terhadap terhadap Tabungan Mudharabah pada Bank BPD Syariah DIY dan Bank Muamalat. Berdasarkan pengujian secara bersama-sama variabel independen (inflasi, nilai tukar (kurs), dan BI Rate) secara bersama-sama tidak berpengaruh signifikan terhadap variabel dependen (Tabungan Mudharabah) pada Bank BPD Syariah DIY. Sebaliknya, Variabel independen (inflasi,nilai tukar (kurs), dan BI Rate) secara bersama-sama mempunyai pengaruh signifikan terhadap variabel dependen (Tabungan Mudharabah) pada Bank Muamalat.