Koperasi merupakan suatu perkumpulan yang beranggotakan orang-orang atau badan-badan, yang memberikan kebebasan masuk dan keluar sebagai anggota, dengan bekerja sama secara kekeluargaan menjalankan usaha, untuk mempertinggi kesejahteraan para anggota. Dalam perkonomian nasional, koperasi sangat diharapkan dapat menempati posisi dan kedudukan yang penting. Koperasi juga diharapkan menjadi soko guru perekonomian nasional Indonesia. Salah satu indikator keberhasilan usaha menejemen koperasi adalah Sisa Hasil Usaha. Sisa Hasil Usaha digunakan untuk peningkatan kesejahteraan anggota dan digunakan untuk menjamin kelangsungan serta kesinambungan kehidupan koperasi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis seberapa besar faktor-faktor yang mempengaruhi sisa hasil usaha pada Pusat Koperasi Pegawai di Kabupaten Pekalongan. Penelitian ini menggunakan data sekunder dari laporan tahunan Koperasi Pegawai Kabupaten Pekalongan periode 2012 hingga 2015. Penelitian ini menggunakan alat analisis regresi data panel dengan menggunakan fixed effect model. Hasil penelitian faktor-faktor yang mempengaruhi sisa hasil usaha diantaranya adalah modal sendiri, modal luar dan jumlah anggota koperasi. Menunjukan bahwa modal sendiri dan modal luar berpengaruh positif dan signifikan terhadap sisa hasil usaha, selanjutnya jumlah anggota berpengaruh negatif dan signifikan terhadap sisa hasil usaha pada Pusat Koperasi Pegawai di Kabupaten Pekalongan.