Rumah sakit merupakan salah satu mata rantai penting dalam sistem pelayanan kesehatan. Rumah sakit menurut fungsinya adalah sebagai tempat penyelenggaraan pelayanan medis, penunjang medis, administrasi dan manajemen, dan juga dapat digunakan sebagai tempat pendidikan/pelatihan dan pengembangan. Kualitas pelayanan kesehatan adalah yang menunjukan pada tingkat kesempurnaan pelayanan kesehatan, dan dapat menimbulkan kepuasan pada pasien. Jenis penelitian ini menggunakan metode penelitian bersifat deskriptif kuantitatif dengan rancangan cross-sectional. Subyek penelitian ini adalah pasien pengunjung rumah sakit (RSGMP UMY dan RS PKU Muhammadiyah Bantul) yang mendapatkan pelayanan kesehatan. Instrument penelitian menggunakan PSQ (Patient Satisfaction Quesioner) yang telah dimodifikasi. Data yang diperoleh dianalisis dengan menggunakan uji Mann-Whitney Test didapatkan hasil nilai signifikansi sebesar 0,329, dimana p >0,05, menunjukkan bahwa tidak terdapat perbedaan bermakna pada tingkat kepuasan pasien. Penelitian ini menujukkan bahwa tidak terdapat yang perbedaan berkmana pada tingkat kepuasan pasien di RSGMP UMY dan RS PKU Muhammadiyah Bantul.