Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis Faktor - Faktor Yang Mempengaruhi Kinerja Perguruan Tinggi Swasta Dengan Penerapan Anggaran Berbasis Kinerja Sebagai Variabel Intervening (Kasus Pada Perguruan Tinggi Swasta Yang Ada Di Kopertis V Yogyakarta Dan Telah Terakreditasi BAN PT). Subjek dalam penelitian ini adalah Wakil Rektor dan Kepala Biro Keuangan di Perguruan Tinggi Swasta Kopertis V Yogyakarta dan telah Terakreditasi BANPT . Dalam penelitian ini sampel berjumlah 60 responden yang dipilih dengan menggunakan metode purposive sampling. Alat analisis yang digunakan adalah Analisis Regresi Linier Sederhana, Uji t, Analisis Path (Path Analyze), dan Uji Sobel. Berdasarkan analisis yang sudah dilakukan diperoleh hasil bahwa Gaya Kepemimpinan Transformasional, Kualitas SDM, Teknologi Informasi, Budaya Organisasi, Komitmen Organisasi berpengaruh positif dan signifikan terhadap Penerapan Anggaran Berbasis Kinerja, selanjutnya Penerapan Anggaran Berbasis Kinerja berpengaruh positif terhadap Kinerja Perguruan Tinggi Swasta, dan Gaya Kepemimpinan Transformasional, Kualitas SDM, Teknologi Informasi, Budaya Organisasi, Komitmen Organisasi berpengaruh positif dan signifikan terhadap Kinerja Perguruan Tinggi Swasta.