Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh gaya kepemimpinan, kompensasi dan budaya organisasi terhadap kinerja karyawan pada Lembaga Keuangan Syariah di Kota Yogyakarta dengan motivasi kerja sebagai variabel intervening. Sampel ini menggunakan lembaga keuangan syariah, yakni BMT Beringharjo, BMT BIF dan Bank Muamalat dengan jumlah responden 40. Dari BMT Beringharjo 3 karyawan, BMT BIF sebanyak 25 karyawan dan Bank Muamalat sejumlah 12 karyawan. Berdasarkan analisis yang telah dilakukan diperoleh hasil bahwa gaya kepemimpinan berpengaruh berpengaruh positif terhadap kinerja karyawan, kompensasi berpengaruh negatif terhadap kinerja karyawan, budaya organisasi berpengaruh negatif terhadap kinerja karyawan, gaya kepemimpinan berpengaruh positif terhadap motivasi kerja, kompensasi berpengaruh positif terhadap motivasi kerja, budaya organisasi berpengaruh positif terhadap motivasi kerja, motivasi kerja berpengaruh positif terhadap kinerja karyawan, gaya kepemimpinan berpengaruh ppositif terhadap kinerja karyawan melalui motivasi kerja, kompensasi berpengaruh positif terhadap kinerja karyawan melalui motivasi kerja, dan budaya organisai berpengaruh positif terhadap kinerja karyawan melalui motivasi kerja pada lembaga keuangan syariah di kota Yogyakarta.